В разных журналах отображаются документы дважды. Проблема частая, с ABCP и обменом не связанная. Способ лечения:
Открываем технический справочник "Ключи реестра документов". Можно открыть через "Все функции".
В форме списка, подсказки и команды для удаления дублей.
Нажать "Запустить процедуру удаления дублей"
После окончания обновить отображения журнала кнопкой F5